Указом Президента РФ № 1719 от 20.12.2007 „О награждении государственными наградами Российской Федерации“ директор педиатрических клиник СГМУ, декан педиатрического и фармацевтического факультетов доктор медицинских наук, профессор Протопопов Алексей Алексеевич за достигнутые трудовые успехи и многолетнюю добросовестную работу награжден медалью ордена „За заслуги перед Отечеством“ II степени.